siRNA和shRNA的区别
siRNA和shRNA简介
siRNA和shRNA虽然都可用于基因干扰,但两者转染媒介、构建方式和细胞内加工过程不完全相同链和币的区别。
siRNA
小干扰核糖核酸(small interfering RNA),指一类长约21-23nt(从文献报道看,19-25nt都是可以的)的双链RNA分子,一般3’端有两个游离的碱基,通过RNA干扰途径沉默目标基因链和币的区别。
siRNA的结构
shRNA
小/短发夹RNA(short hairpin RNA),是一种依赖茎环序列产生的短双链RNA结构(19-25nt),可利用载体导入细胞当中,在细胞中经酶切形成siRNA,通过RNA干扰途径调控目标基因链和币的区别。
shRNA的结构
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siRNA一般是人工合成的线性双链RNA(dsRNA),shRNA则是通过发卡结构形成的局部双链RNA链和币的区别。siRNA和shRNA的双链区是完全互补配对的。shRNA在细胞内被Dicer酶切割后形成siRNA,通过siRNA途径行使干扰功能。
siRNA与shRNA的区别
siRNA 是化学合成的小干扰 RNA,而 shRNA 是克隆构建所得,具有茎环结构链和币的区别。
siRNA 是直接合成针对靶基因的 siRNA,通过转染的方法使之进入细胞内,参与到 RNAi 途径,发挥使靶基因沉默的效应链和币的区别。
shRNA 是构建的 shRNA 质粒表达载体或者是病毒载体病毒包装后,通过直接转染或者感染,利用细胞内的 Dicer 酶,生成相应的 siRNA,发挥 RNAi 作用链和币的区别。
shRNA具有更长的作用时效:siRNA的稳定性较低,进入细胞后会逐渐被降解,因此只能在短期内(一周左右)实现对靶基因的沉默;shRNA借助表达载体可以在细胞内大量转录,因此靶基因的沉默时效更长,可以持续数个星期链和币的区别。
shRNA对于难转染的细胞效果更好:siRNA主要通过转染进入细胞,难转染的细胞会严重影响siRNA的功能;shRNA可借助病毒导入细胞,对于难转染的细胞仍然有很高的导入效率,因此对于难转染的细胞干扰效果更好链和币的区别。
shRNA脱靶率更低:有证据表明shRNA的脱靶更低,可能是由于siRNA在细胞质中逐渐降解导致脱靶链和币的区别。
siRNA与shRNA各自具有不同的优缺点链和币的区别。根据实验目的的不同,以及它们各自的特性,我们可以有针对性的选择最适合的干扰工具。
作者:海星生物
公众号:海星生物科技 / 苏州海星生物
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